Bonjour,
J'ai un problème avec une sequence de protéines que notre prof nous a donné.
Le but est d'identifier le type de protéine (sans pour autant utiliser BLAST) "à l'oeil".
Voici la sequence :
>unknown protein 1
MKKFLPGLLLMGLVACSSNQRMSDYSQPES QSDLAPKSSTTQFQPQPLLSKASSMPLNLL SSSKNGQVSPSEPSNFMTLMGQNGALLTVW ALAKRNWLWAYPNIYSQDFGNIRNWKIEPG KHREYFRFVNQSLGTCIEAYGNGLIHDTCS LDKLAQEFELLPTDSGAVVIKSVSQGRCVT YNPVSPTYYSTVTLSTCDGATEPLRDQTWY LAPPVLEATAVN
D'apres mon corrigé, c'est une lipoprotéine située sur membrane externe... Donc en gros, il doit y avoir une sequence spéciale qui permet d'affirmer cela, mais laquelle?
Merci pour votre aide,
Jonathan
J'ai un problème avec une sequence de protéines que notre prof nous a donné.
Le but est d'identifier le type de protéine (sans pour autant utiliser BLAST) "à l'oeil".
Voici la sequence :
>unknown protein 1
MKKFLPGLLLMGLVACSSNQRMSDYSQPES QSDLAPKSSTTQFQPQPLLSKASSMPLNLL SSSKNGQVSPSEPSNFMTLMGQNGALLTVW ALAKRNWLWAYPNIYSQDFGNIRNWKIEPG KHREYFRFVNQSLGTCIEAYGNGLIHDTCS LDKLAQEFELLPTDSGAVVIKSVSQGRCVT YNPVSPTYYSTVTLSTCDGATEPLRDQTWY LAPPVLEATAVN
D'apres mon corrigé, c'est une lipoprotéine située sur membrane externe... Donc en gros, il doit y avoir une sequence spéciale qui permet d'affirmer cela, mais laquelle?
Merci pour votre aide,
Jonathan
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